Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT34O76011 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT34O76011 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT34O76011 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT34O76011 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT34O76011 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT34O76011 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT34O76011 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT34O76011 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT34O76011 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT34O76011 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT34O76011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT34O76011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT34O76011 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT34O76011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT34O76011 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT34O76011 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT34O76011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT34O76011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT34O76011 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT34O76011 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT34O76011 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT34O76011 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT34O76011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT34O76011 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms