Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH4O75427 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH4O75427 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms