Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAB11FIP3O75154 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB11FIP3O75154 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB11FIP3O75154 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms