Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN2BO60939 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN2BO60939 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN2BO60939 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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