Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SORBS3O60504 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SORBS3O60504 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SORBS3O60504 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms