Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX3O60493 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX3O60493 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX3O60493 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX3O60493 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX3O60493 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX3O60493 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX3O60493 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX3O60493 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX3O60493 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX3O60493 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX3O60493 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX3O60493 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX3O60493 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX3O60493 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX3O60493 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX3O60493 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX3O60493 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX3O60493 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX3O60493 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX3O60493 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX3O60493 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX3O60493 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX3O60493 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX3O60493 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX3O60493 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX3O60493 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX3O60493 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX3O60493 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX3O60493 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX3O60493 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX3O60493 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX3O60493 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX3O60493 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX3O60493 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX3O60493 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX3O60493 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX3O60493 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX3O60493 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms