Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN3BO60391 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN3BO60391 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN3BO60391 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms