Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
URB1O60287 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
URB1O60287 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
URB1O60287 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
URB1O60287 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
URB1O60287 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
URB1O60287 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
URB1O60287 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
URB1O60287 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
URB1O60287 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
URB1O60287 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
URB1O60287 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
URB1O60287 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
URB1O60287 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
URB1O60287 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
URB1O60287 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
URB1O60287 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
URB1O60287 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
URB1O60287 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
URB1O60287 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
URB1O60287 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
URB1O60287 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
URB1O60287 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
URB1O60287 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
URB1O60287 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
URB1O60287 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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