Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX1O43933 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX1O43933 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX1O43933 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX1O43933 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX1O43933 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX1O43933 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX1O43933 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX1O43933 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX1O43933 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX1O43933 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX1O43933 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX1O43933 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX1O43933 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX1O43933 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX1O43933 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX1O43933 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX1O43933 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX1O43933 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PEX1O43933 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX1O43933 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX1O43933 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX1O43933 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms