Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNGR3O43761 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms