Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR3O43731 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR3O43731 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms