Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRS3O43559 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRS3O43559 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRS3O43559 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRS3O43559 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRS3O43559 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRS3O43559 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FRS3O43559 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRS3O43559 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRS3O43559 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRS3O43559 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRS3O43559 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRS3O43559 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRS3O43559 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRS3O43559 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRS3O43559 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRS3O43559 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRS3O43559 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FRS3O43559 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRS3O43559 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRS3O43559 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FRS3O43559 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRS3O43559 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms