Protein–RNA interactions for Protein: O43548

TGM5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM5O43548 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TGM5O43548 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TGM5O43548 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGM5O43548 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGM5O43548 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM5O43548 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM5O43548 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM5O43548 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGM5O43548 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM5O43548 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM5O43548 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM5O43548 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM5O43548 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM5O43548 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGM5O43548 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGM5O43548 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGM5O43548 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM5O43548 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM5O43548 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM5O43548 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM5O43548 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM5O43548 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGM5O43548 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGM5O43548 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM5O43548 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM5O43548 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM5O43548 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGM5O43548 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TGM5O43548 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGM5O43548 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGM5O43548 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms