Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8B1O43520 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP8B1O43520 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8B1O43520 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms