Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF12O43508 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNFSF12O43508 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms