Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTRA2O43464 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA2O43464 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms