Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA3O43365 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA3O43365 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.1 ms