Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SRGAP3O43295 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP3O43295 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP3O43295 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms