Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GPAA1O43292 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GPAA1O43292 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GPAA1O43292 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms