Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA2O43164 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA2O43164 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA2O43164 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA2O43164 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA2O43164 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA2O43164 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PJA2O43164 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PJA2O43164 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA2O43164 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA2O43164 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA2O43164 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA2O43164 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA2O43164 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA2O43164 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA2O43164 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA2O43164 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA2O43164 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA2O43164 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA2O43164 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA2O43164 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA2O43164 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA2O43164 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA2O43164 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA2O43164 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA2O43164 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA2O43164 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA2O43164 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PJA2O43164 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PJA2O43164 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PJA2O43164 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PJA2O43164 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PJA2O43164 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms