Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGSM2O43147 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SGSM2O43147 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGSM2O43147 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms