Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NUPL2O15504 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NUPL2O15504 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms