Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD3EAPO15446 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD3EAPO15446 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD3EAPO15446 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms