Protein–RNA interactions for Protein: O15055

PER2, Period circadian protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER2O15055 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PER2O15055 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PER2O15055 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PER2O15055 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PER2O15055 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PER2O15055 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PER2O15055 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PER2O15055 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PER2O15055 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER2O15055 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PER2O15055 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER2O15055 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER2O15055 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER2O15055 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PER2O15055 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PER2O15055 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PER2O15055 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER2O15055 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER2O15055 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER2O15055 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PER2O15055 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER2O15055 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER2O15055 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PER2O15055 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PER2O15055 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PER2O15055 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PER2O15055 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms