Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA3EO15041 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SEMA3EO15041 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA3EO15041 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3EO15041 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms