Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GIPC1O14908 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms