Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBFD1O14562 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBFD1O14562 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBFD1O14562 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBFD1O14562 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms