Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC7O00311 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC7O00311 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC7O00311 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC7O00311 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC7O00311 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC7O00311 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC7O00311 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC7O00311 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC7O00311 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC7O00311 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC7O00311 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC7O00311 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC7O00311 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC7O00311 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC7O00311 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC7O00311 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC7O00311 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC7O00311 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC7O00311 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC7O00311 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC7O00311 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC7O00311 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC7O00311 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC7O00311 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC7O00311 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms