Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARVCFO00192 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARVCFO00192 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARVCFO00192 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms