Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMIM22K7EJ46 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMIM22K7EJ46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms