Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PBE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PBE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PBE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PBE3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PBE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PBE3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E9PBE3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PBE3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PBE3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PBE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PBE3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PBE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E9PBE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PBE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PBE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PBE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PBE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PBE3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E9PBE3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E9PBE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E9PBE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PBE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PBE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PBE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PBE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
E9PBE3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PBE3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PBE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PBE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PBE3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PBE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PBE3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PBE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PBE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PBE3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PBE3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PBE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PBE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms