Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00587B1AMM8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00587B1AMM8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00587B1AMM8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms