Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALM2-AKAP2B1ALY0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms