Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP27XA6NNY8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP27XA6NNY8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms