Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GLTPD2A6NH11 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GLTPD2A6NH11 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLTPD2A6NH11 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GLTPD2A6NH11 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GLTPD2A6NH11 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GLTPD2A6NH11 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms