Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C5orf51A6NDU8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C5orf51A6NDU8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms