Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6BA6NDN3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6BA6NDN3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms