Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LAMB4A4D0S4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMB4A4D0S4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMB4A4D0S4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMB4A4D0S4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms