Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF27A3QJZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms