Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIPSLA2A3N6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPSLA2A3N6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms