Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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