Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNX13Q9Y5W8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms