Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
HECTD4Q9Y4D8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms