Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SH3BP1Q9Y3L3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP1Q9Y3L3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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