Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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