Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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