Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGC1AQ9UBK2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms