Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPG2Q9UBF2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms