Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCND1Q9NSA2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms