Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms